تماشيًا مع تطوير PTAIN ، في 1 يناير 1957 ، تم إنشاء أكاديمية العلوم الدينية ، [كلية الدولة للعلوم الإسلامية] (Adia) في جاكرتا بناءً على وزير الدين رقم 1 لعام 1957. تهدف هذه الأكاديمية إلى تحسين جودة المعلمين الإسلاميين في المدارس الثانوية.

في العقد الأول ، نما كل من PTAIN و Adia وتطورتا بشكل كبير. من أجل تحسين مراقبة الجودة المؤسسية بشكل متكامل ، تم دمج PTAIN و Adia في مؤسسة جديدة تسمى معهد الدولة للدراسات الإسلامية في 24 أغسطس 1960 على أساس المستوى الحكومي رقم 11/1960. تقع هذه المؤسسة في يوجياكارتا ولديها أربع كليات ، وهي Tarbiyah و Adab في جاكرتا و Syari'ah و Ushuluddin في يوجياكارتا. بناءً على الدرجة رقم 26/1965 للحكومة ، تم تسمية IAIN Yogyakarta باسم IAIN Sunan Kalijaga ، ويأتي الاسم من الداعية الإسلامي البارز في إندونيسيا الذي يتمتع بسلطة إدارة جميع الكليات الأربع في يوجياكارتا.

تعتبر التربية حاليًا واحدة من الكليات الرائدة في UIN Sunan Kalijaga لديها عشرة برامج جامعية وخمسة برامج ماجستير وبرنامج دكتوراه واحد. (1) يشمل برنامج البكالوريوس (أ) التربية الدينية الإسلامية (تعليم الإسلام) ، (ب) تعليم اللغة العربية (تعليم اللغة العربية) ، (ج) التربية الإسلامية (التربية الإسلامية) ، (د) المدرسة الإبتدائية لتعليم المعلمين (تعليم المعلمين في MI) )) ، (هـ) التربية الإسلامية في مرحلة الطفولة المبكرة (PIAUD) ، (و) برنامج التعليم المهني للمعلمين (PPG) ، (ز) تعليم الرياضيات ، (ح) تعليم الفيزياء ، (ط) تعليم الكيمياء ، (ي) تعليم الأحياء. (2) يشتمل برنامج الماجستير على (أ) التربية الدينية الإسلامية (تعليم الإسلام) ، (ب) تعليم اللغة العربية (تعليم اللغة العربية) ، (ج) التربية الإسلامية (التربية الإسلامية) ، (د) المدرسة الإبتدائية لتعليم المعلمين (تعليم المعلمين في MI) )) ، (هـ) التربية الإسلامية في مرحلة الطفولة المبكرة (PIAUD). (3) يشمل برنامج الدكتوراه: